第二十一条 口岸检验检疫机构凭产地检验检疫机构签发的换证凭单查验换证的，只收取签发证(单)工本费，不得收取查验费等其它任何费用。
第二十二条 过境植物、动植物产品，入境口岸检验检疫机构只检疫运输工具和包装物，按规定收取运输工具和包装物检验检疫费。根据有关法律、行政法规规定，需对植物、动植物产品抽样检疫的，按本办法及其收费标准收费。
过境动物，根据实际检验检疫要求，按照动物检疫收费项目标准收取检疫费。
第二十三条 检验检疫机构对进口食品，食品添加剂，食品容器，包装材料，食品用工具、设备，用于食品和食品用工具设备的洗涤剂、消毒剂等(含来料加工、出口返销、在免税商店出售的上述货物)实施卫生监督检验的，按本办法及其收费标准收取食品及食品加工设备卫生检验费用。
进口食品单一品种在100吨以下和非单一品种在500吨以下的，按小批量食品收费标准计收费。
第二十四条 边境口岸每批次价值在人民币10万元以下(含10万元)的小额边境贸易检验检疫收费，按本办法规定收费标准的70%计收;每批次价值在人民币5万元以下(含5万元)的小额边境贸易检验检疫收费，按本办法规定收费标准的50%计收。
第二十五条 出入境关系人因故撤销检验检疫时，检验检疫机构未实施检验检疫的，不得收费;已实施检验检疫的，按收费标准的100%计收。因检验检疫机构责任撤销检验检疫的，不得收费。
第二十六条 出入境关系人应按照有关法律、法规和本办法及其收费标准，按时足额交纳检验检疫费用。自检验检疫机构开具收费通知单之日起20日内，出入境关系人应交清全部费用，逾期未交的，自第21日起，每日加收未交纳部分5‰的滞纳金。
第二十七条 检验检疫机构应严格按照本办法及其收费标准收费，到指定的价格主管部门办理收费许可证，出具财政部规定使用的票据。
第二十八条 各检验检疫机构应公开收费项目和收费标准，接受价格、财政部门的检查监督，不得擅自增加或减少收费项目，不得擅自提高或降低收费标准，不得重复收费。
第二十九条 本办法自2004年4月1日起执行。过去有关出入境检验检疫收费规定与本办法不一致的，一律废止。