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2） 运输检疫的组织和方法
⑴ 起运前检疫的组织
按照运输检疫的要求，凡托运的动物到车站、码头后，应先休息2～3小时，然后进行检疫。全部检疫过程，应自到达时至装车时止，争取在6h以内完成。进行检疫时，先验讫押运员携带的检疫证明。凡检疫证明在3d内填发者，车站、码头动检人员只进行抽查或复查，不必详细检查。若交不出检疫证明，或畜禽数目、日期与检疫证明不符又未注明原因，或畜禽来自疫区，或到站后发现有可疑传染病病畜死禽时，车站码头动检人员必须彻底查清，实施补检。认为安全后出具检疫证明，准于启运。
车站码头检疫因有时间限制，必须以简便迅速的方法进行。检查牛体温可采用分组测温法，每头牛测温时间尽可能有10min.猪、羊的检疫最好利用窄廊，窄廊一般长13m，高0.65m，宽0.35～0.42m，两侧用圆木或木板构成，两端设有活门，中间留有适当的空隙，以便检查和测温。检查中发现有病畜，按规定处理。
⑵ 运输途中或过境检疫的组织
检查点最好设在预定供水的车站、码头。检疫时除查验有关检疫证明文件外，还应深入车、船仔细检查畜群。若发现有传染病时，按规定要求处理。必要时要求装载动物的车船到指定地点接受监督检查处理。待正常安全后方准运行。车船运行中发现病畜、死畜、可疑病畜时，立即隔离到车船的一角，进行救治及消毒，并报告车船负责人，以便与车站码头畜禽防检机构联系，及时卸下病、死家畜，在当地防检人员指导下妥善处理。
⑶ 运到目的地检疫的组织
动物运到卸载地时，动检人员应对动物重新予以检查。首先验讫有关检疫证明文件，再深入车船仔细地观察畜群健康情况，查对畜禽数目。发现病畜或畜禽数目不符，禁止卸载。待查清原因后，先卸健畜，再卸病畜或死畜。在未判明疾病性质或死畜死亡原因之前，应将与病畜或尸体接触过的家畜，进行隔离检疫。有时尽管押运人员报告死畜是踩压致死，但也不可疏忽大意，因为途中被踩死的家畜，往往是由于患了某些急性传染病的家畜。
在各种运输检疫中都应与运输等有关部门的协作，运输检疫一定会遇到很多困难。因此在组织运输检疫时，应根据具体情况，必须与运输等有关部门作好协调工作。