结核性腹膜炎的治疗的关键是及早给予合理、足够的抗结核化学药物治疗，以达到早日康复、避免复发和防止并发症的目的。注意休息和营养，以调整全身情况和增强抗病能力是重要的辅助治疗措施。
1.抗结核化学药物治疗：抗结核化学药物的选择、用法、疗程详见肺结核章。在结核性腹膜炎的应用中应注意：对一般渗出型病例，由于腹水及症状消失常不需太长时间，患者可能会自行停药，而导致复发，故必须强调全程规则治疗；对粘连型或干酪型病例，由于大量纤维增生，药物不易进入病灶达到应有浓度，病变不易控制，故应加强抗结核化疗的联合应用并适当延长抗结核的疗程。
2.如有大量腹水，可适当放腹水以减轻症状。
3.手术适应证包括：①急性肠穿孔，或腹腔脓肿经抗生素治疗未见好转者；②并发完全性肠梗阻或有不全性肠梗阻经内科治疗而未见好转者；③肠瘘经抗结核化疗与加强营养而未能闭合者；④本病诊断有困难，与腹腔肿瘤或急腹症不能鉴别时，可考虑剖腹探查。