先天性肌性斜颈的发生原因仍不清楚。但有以下几种学说：
1.创伤学说：生后或生后两周内可扪及颈部包块，与臀位产或使用产钳等因素有关。但有些剖腹产的新生儿也可发生斜锁。
2.子宫内压力学说：胎儿在子宫内的头颈部位置异常造成胸锁乳突肌缺血所引起。