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血栓闭塞性脉管炎病变主要位于中小动静脉，而以动脉为主。
血栓闭塞性脉管炎不同于动脉硬化，病变主要侵及周围中、小动静脉，通常起于动脉，然后可累及静脉，极大多数位于下肢，其次为上肢，病变一般由远端向近端进展。而动脉硬化好发于大、中型动脉。