除常规的术前准备外，结肠手术必须要做好肠道准备包括：
①清洁肠道：手术前二天进少渣或无渣饮食;术前1～2天服缓泻剂，若有便秘或不全肠梗阻者酌情提前几天用药;清洁灌肠，根据有无排便困难可于术前一日或数日进行。
②肠道消毒：杀灭肠道内致病菌，尤其是常见的厌氧菌如脆弱拟杆菌等，以及革兰氏阴性需氧杆菌。其药物前者主要是应用甲硝唑(灭滴灵)，后者可用磺胺类药物，新霉素、红霉素、卡那霉素等。肠道准备充分，可减少术中污染，减少感染有利愈合。
目前国内外一些医院有采取全肠道灌洗方法作肠道准备，方法是由胃管滴注或口服特殊配制的灌洗液(含一定浓度的电解质及肠道消毒剂，保持一定的渗压)，用量4～8升，蹲坐于排便装置上。可同时达肠道清洁和消毒的目的。