辞書には
『〔形口〕卆じゃまくさ・し〔形ク〕（「くさい」は接尾語）邪魔に思われる。めんどうくさい。＊滑・大わらい臍の西国‐不性者の独りごと「起きた所が晩にまた寝るのがじゃまくさい」
国語大辞典（新装版）小学館 1988』
と載っています。
「くさい」は接尾語だそうですが、「くさい」を取って「じゃま」だけにすると違う意味になってしまいます。
「じゃーくさい」とも言います。
【例】
「なんべんもなんべんもじゃまくさいなぁ。一回で言えよ、一回で」
私の母は、「ご面倒ですが」とか「お手数をおかけしますが」言う意味で「えらいおじゃまですけど」という言い方をします。
ということは「じゃまくさい」の「くさい」を取って「じゃま」だけにしても、「めんどう」という意味があるのでしょうか。