叶绿体基质中可发生CO2→C6H12O6，线粒体基质中可发生丙酮酸→CO2；叶绿体中类囊体薄膜上发生水的分解并产生ATP，线粒体内膜上发生水的合成；叶绿体基质中随有机物合成会消耗ATP，线粒体基质中随有机物分解会产生ATP；叶绿体中能将光能转变成化学能，线粒体中能将稳定的化学能转变成活跃的化学能。