日本是物流大国，围绕现代制造业和现代流通业以及城市管理和运行的各个环节，从国际海运到住宅配送，日本的物流无处不在。物流渗透到日本社会经济的各个角落，存在于国民生活的每个细节。
在日本，物流涉及到众多行业，具体为卡车运输业、铁道运输业、內航海运业、外航海运业、港湾运输业、航空运输业、铁道货运代理业、外航货运代理业、航空货运代理业、仓库业和卡车货运站共11个行业。
日本的物流业总体经济规模有41兆日元，其中经营性物流21兆日元，自营物流18兆日元。物流经营者有约7万家，从业人员约139万人。
在自营物流中，卡车运输占58%，货物保管占29.7%，內航海运占4.3%，港湾运输占2.7%，铁道运输占0.3%，国内航空占0.1%，其它占0.5%，管理占4.4%.
日本物流业产生的货物运输量从1990年到2004年保持了比较平稳的发展态势。2004年总货运量55.7亿吨，总货物周转量5700亿吨公里，其中道路货运量和货物周转量比重分别为91.1%和57.6%，均占各行业之首。运距在100公里以内的货物运输中，90%是通过道路运输的，运距在1000公里以内的货物运输中，30%是道路运输，60%是海运，10%是铁道或航空运输。
国际物流：“绿色覆盖计划”
国际物流在日本物流业中的地位十分重要，这与日本是资源输入国和外贸大国有关。在运输量上，海运占据了几乎百分之百的份额，2004年达到9.4亿吨，而航空运输只有326万吨；在货物价值方面，海运为765130亿日元，占69%，航空运输为33850亿日元，占31%.近年来，国际海运和航空运输都呈现同步增长趋势。
随着对外贸易输入输出国家和地区的变化，日本国际物流结构也随之变化。2005年日本外贸输入额56.9兆日元，比上年增加15.7%.中国为主要输入国，输入额12.1兆日元，比上年增加17%.2005年日本外贸输出额65.7兆日元，比上年增加7.3%.中国为第二位输出国，输出额12.8兆日元，比上年增加8.2%.2005年中国为日本外贸输入输出总额最多的国家，输入输出总额为24.9兆日元，占日本外贸输入输出总额的20.4%.
我国改革开放以来，日本企业在中国国内投资建厂的越来越多。日本企业在中国国内设立的法人企业由2000年的2530家，增加到2004年的3557家，增长了1.4倍。日本在华企业外贸输出额由2000年的7410亿日元，增加到2004年的18830亿日元，增长了2.5倍；输入额由2000年的7510亿日元，增加到2004年的1962亿日元，增长了2.6倍。
由于国际采购和跨国生产的需要，日本与各贸易伙伴国家之间的物流合作与日俱增。日本物流企业实行了所谓的“绿色覆盖计划”，即物流企业在国内的合作伙伴将工厂或者商店开到哪个国家，物流企业便跟着把物流服务的网络铺设到哪里。如日本的日通、近铁、山九、佐川急便等著名物流企业，都在中国开设了独资或者合资的物流企业，服务对象基本上是日资企业。
物流推进政策：P—D—C—A
日本政府对国家物流发展给以高度关注，制定了明确的推进政策。日本《综合物流施策大纲（2005-2009）》中，明确了日本物流发展的基本方向是：适应经济和社会的全面发展，使物流与新的产业和消费市场共同发展，缩短物流对生产、流通和消费造成的距离。
日本物流政策的立足点是：按照京都议定书，制定和实行更加有效的环境保护政策，大幅度削减C02的排放，使物流企业真正履行社会责任。增强日本物流的国际竞争力，降低物流成本，促进国际物流与国内物流一体化。采取更加严格的措施，保障物流安全，防止恐怖事件对物流的影响。
为了有效地实施物流政策，日本政府成立了由国土交通省等相关政府部门组成的综合物流施策推进会议，实施综合性、一体化的物流推进计划，具体分为Plan、Do、Check、Action四个环节。
“PLAN”是指由综合物流施策推进会议所制定的具体措施：促进综合物流效率提高，优化道路环境和通行时间；促进物流标准化、信息化；培养综合物流人才；促进国际物流与国内物流的一体化；发挥运输枢纽作用，完善港口和公路干线附近的物流据点，提高货物集散能力；促进都市物流圈建设，实现物流网络化；改革关税制度，有利于综合物流发展；提高物流安全性和应对灾害的能力等。
“DO”的总体要求是促进物流业者的联合。即推动物流企业间的合作，实现共同配送，提高城市物流效率；推动地区间的物流合作，建设大型物流中心；推动各种运输方式间的物流合作，发展大型货车和集装箱运输，用国际标准集装箱取代铁路非国际标准集装箱；推动中日韩物流合作，倡导加快发展东北亚综合物流等。