1.在实践中，双方均予认可的电子证据，其打印件应当作为证据认定。因为，当事人的承认性陈述本身就可以作为证据认定，而这种承认性陈述又可被电子证据的内容所印证。
2.如当事人只提交打印稿，而原件已从电脑中永久删除的，除对方认可，该打印稿不可作为定案根据，因为根本无法判断是否就是原件。这时，不能以对方举不出反证而确认该证据有效。
3.对有争议的电子证据，应先核对其电子签名，如相符，应认定系拥有该电子签名的人所收发。因为，电子签名就是代表各人身份的电子标记，如私人印章一般，自己应当有保管义务，即使为他人盗用，也应对善意相对人承担责任。
4.由于电子系统的专业技术性太强，如使用公用资源的非注册用户或电脑“黑客”侵袭等就应另当别论。因此，对电子证据的取证将十分重要。目前，只能向网络服务提供商进行调查和证据保全，查明对电子证据有无删改，再确定收发件网址与时间等。必要的情况下，应当引入专家评定制度，即由专门机构和专家对技术上的问题进行认证鉴定，以保证最大限度的公正合理性。