（3）治疗的深入
1）阻抗的处理。病理性的冲突包含内驱力和其他的动机以及反抗这些动机的禁忌。它们通常与早年的生活有关。心理动力性治疗的设置和程序，激励出那些早年的婴儿式的冲突。在当事人比较自由地谈论他的困惑时，通常意识、前意识和潜意识的动机混合在一起。
病理性的冲突唤醒痛苦的情感，由于禁忌的力量，当事人会下意识地压抑这些导致冲突的情感，并阻止心灵真实的显现。在治疗过程中，当事人这种对治疗过程有意或无意的对抗，被称之为阻抗（ resistance）。
阻抗是心理动力性治疗过程中必见的一环。当事人由开始的积极配合心理咨询师到有意无意地对抗治疗，表现为自由联想时头脑一片空白、对过去的记忆也是空白，治疗中迟到等。阻抗是心理动力性治疗过程的基本部分，且是有价值的部分，它是当事人处理日常生活、人际关系中遭遇苦恼的方法。
处理阻抗的一种方法是讨论阻抗本身，而不是更深入地探究其背后的冲突或焦虑，经典精神分析心理咨询师把这称为对防御的解释，称这一过程为“注意”阻抗就足够了。例如，如果通过讨论无关紧要或无意义的话题表现出了阻抗，可以选择说：“我注意到，当我们开始讨论你的配偶可能对你的抑郁有何影响时，你通常开始谈论电视节日、办公室的装饰、国际问题，以及其他似乎与你和配偶的关系无关的事情。”有时，只要注意阻抗的模式就具有一定面质功能，并鼓励了来访者审视自己的行为并开始作出建设性改变。
2）退行。在阻抗之后，随着治疗关系的深入，当事人将出现退行。退行（ regrcs-sion）意味着当事人的精神功能，在治疗场景中退回到了较早期的水平（较幼稚）。随着退行的出现，早期导致冲突的动机也被激活。
临床表明，可导致退行的情形主要有痛苦的情感、当事人寻求帮助、治疗的基本方法（自由联想和心理咨询师激烈的关系）等。在心理动力性治疗中，有些观点认为悟性是导致精神变化的主要机制；有的认为促进发展也是重要的。但一致的看法是退行在这些过程中起了必不可少的作用。在这个过程中，许多卷入病态冲突的潜意识记忆和幻想被唤醒。退行激活了这些情感并将其转换进入移情中，这些被唤醒的情感和冲突因而成了分析工作的切入点，并为修通带来契机，也为治愈当事人疾病提供了机会。同样地，当事人也可能会意识或潜意识地利用退行，有些当事人不太可能去允许自己退行，另外一些当事人不太能限制退行，以致出现有害的退行，对这样的退行需要特别的控制。
3）移情与反移情的识别与处理。移情是心理动力治疗中最具特征性的过程。移情被定义为一种反应，它具有不适当的、情绪激烈的并总是具有意识或潜意识的矛盾情感，有时反复无常和黏着的特征。虽然在心理咨询师和当事人之间现实的关系中通常也具上述特征，但这种关系比移情关系更具现实一般人际关系的特征。
心理咨询师保持对反移情的觉醒，理解它们的源泉，特别是它们内在精神对应的互动形式，即对方什么样的内在精神激起了自己如此的反应。保持对这些情感的觉醒，对于帮助理解当事人的内心世界是非常重要的。在这个过程中，节制和中立是咨询师需要采取的态度。
在精神分析的末期，一个较戏剧性的变化在移情里发生。在长达几年的治疗过程中，当事人慢慢地开始越来越多地看清心理咨询师的真实状况，发现心理咨询师不像自己先前想象的那样理想化，而是一个善良但与其他常人一样的个体。当事人逐渐认识到，不实在的情感、幻想、欲望和恐惧，是来自于过去的执著。在刚刚发现这些变化时，也常常会激起当事人抗拒的情感。但是，这些抗拒逐渐地变少了，以致可以更容易地去理解和处理这些发现。这些变化被称之为移情性神经症的修复（the resolution ofthe transferencc neurosis）。这种当事人与心理咨询师之间移情性情感的消失，意味着当事人精神领域决定性变化的完成。