有氧呼吸的第三阶段在线粒体内膜上进行，因此吡唑醚菌酯主要抑制真菌有氧呼吸的第三阶段；吡唑醚菌酯抑制细胞呼吸，导致能量无法产生，无法合成ATP；真菌种群中存在抗药性个体和非抗药性个体，长期使用吡唑醚菌酯，可导致真菌种群抗药性增强；厌氧微生物为无氧呼吸，吡唑醚菌酯无法抑制。