大学的课程分为两个阶段，即：
一、基础阶段 (Grundstudium) ：通常为4个学期，主要学习基础课程。
二、专业阶段 (Hauptstudium) ：因专业而异，一般为4 - 8个学期或更长，学习硕士专业课程，做毕业设计以及撰写毕业论文。
修完基础阶段的课程，积累足够的学分单 (Scheine) 后，必须通过"中期考试"(Zwischenpruefung, Vordiplompruefung, Diplomvorpruefung) 才能进入专业阶段。
修完专业课程，通过毕业考试，完成毕业论文，即可获得相应的学位。毕业考试根据不同学科分为高校考试、国家考试和教会考试三种。大学的理科、工科、经济学和社会学某些专业的学历文凭为Diplom；语言、文化、法律和部分经济、社会等人文学科的学历文凭为Magister/Magistra Artium (M.A.)；考取教师、律师、医生和药剂师等则授予"国家考试 (Staatsexamen) 证书"；应用科学大学的学历文凭均为Diplom (FH)；艺术和音乐院校的学历文凭为Magister或相应的证书。以上文凭均具有同等的"职业鉴定资格"。
新设的"国际课程" (Internationale Studiengaenge)，根据学制长短可分别获得不同的学位：学习5-6个学期考试合格获"学士" (Bachelor) 学位、在此基础上再学3 - 4个学期可获"硕士"(Master/Diplom/Magister) 学位。
高校毕业获得硕士学位，如果成绩优异，经教授（博士导师Doktorvater）同意，可继续攻读博士学位。