基金管理公司是证券投资基金会计核算的主体，对所管理的基金应当以每只基金为会计核算主体，独立建账、独立核算，保证不同基金在名册登记、账户设置、资金划拨、财簿记录等方面相互独立。
一、基金会计核算的特殊性
(一)会计主体是证券投资基金。
(二)会计分期细化到日。目前我国的基金会计核算均已细化到日，每日都要细化报表提供保值。
(三)基金持有的金融资产和承担的金融负债通常归类为以公允价值计量且其变动计入当期损益的金融资产和金融负债
二、基金会计核算的主要内容
1 证券交易及其清算的核算
2 权益事项的核算
3 各类资产的利息核算
4 基金费用的核算
5 开放式基金份额申购、赎回的核算
6 投资估值增减值的核算
7 本期收益及收益分配的核算
8 基金会计报表
9 基金会计核算的复核