(一)内部控制的目标
内部控制的目标是：保证业务运作严格遵守国家有关法律法规和行业监管规则，自觉形成守法经营、规范运作的经营思想和经营风格;防范和化解经营风险，保证托管资产的安全完整;维护持有人的权益;保障基金托管业务安全、有效、稳健运行。
(二)内部控制的原则
1.合法性原则。内控制度应当符合国家法律法规及监管机构的监管要求，并贯穿于托管业务经营管理活动的始终。
2.完整性原则。托管业务的各项经营管理活动都必须有相应的规范程序和监督制约;监督制约应渗透到托管业务的全过程和各个操作环节，覆盖所有的部门、岗位和人员。
3.及时性原则。托管业务经营活动必须在发生时能准确及时地记录;按照“内控优先”的原则，新设机构或新增业务品种时，必须做到已建立相关的规章制度。
4.审慎性原则。各项业务经营活动必须防范风险，审慎经营，保证基金资产的安全与完整。
5.有效性原则。内控制度应根据国家政策、法律及经营管理的需要适时修改完善，并保证得到全面落实执行，不得有任何空间、时限及人员的例外。
6.独立性原则。托管人托管的基金资产、托管人的自有资产、托管人托管的其他资产应当分离;直接操作人员和控制人员应相对独立，适当分离;内控制度的检查、评价部门必须独立于内控制度的制定和执行部门。