这些问题产生的根源在于，中国资本市场是在向市场经济转轨过程中由试点开始而逐步发展起来的新兴市场，早期制度设计有很多局限，改革措施不配套。一些在市场发展初期并不突出的问题，随着市场的发展壮大，逐步演变成市场进一步发展的障碍，包括上市公司改制不彻底、治理结构不完善;证券公司实力较弱、运作不规范;机构投资者规模小、类型少;市场产品结构不合理，缺乏适合大型资金投资的优质蓝筹股、固定收益类产品和金融衍生产品;交易制度单一，缺乏有利于机构投资者避险的交易制度;等等。
解决措施：
1.《关于推进资本市场改革开放和稳定发展的若干意见》的发布
国务院于2004年1月31日发布《关于推进资本市场改革开放和稳定发展的若干意见》，将发展中国资本市场提升到国家战略任务的高度，提出了九个方面的纲领性意见，为资本市场的进一步改革与发展奠定了坚实的基础。
2.股权分置改革
股权分置改革的顺利推进使国有股、法人股、流通股利益分置、价格分置的问题不复存在，各类股东具有一样的上市流通权和相同的股价收益权，各类股票按统一市场机制定价，二级市场价格开始真实反应上市公司价值，并成为各类股东共同的利益基础。因此，股权分置改革为中国资本市场优化资源配置奠定了市场化基础，使中国资本市场从市场基础制度层面与国际市场不再有本质的差别。
3.全面提高上市公司质量
完善上市公司监管体制。规范公司治理。清欠违规占用上市公司资金。
建立股权激励机制的规章制度，推动市场化并购重组。建立股权激励机制。
推动市场化并购重组。
4.证券公司综合治理
2004年前后，证券公司长期积累的问题充分暴露，风险集中爆发，全行业生存与发展遭遇严峻的挑战。
2004年中国证监会制定了创新类和规范类证券公司的评审标准;……
2007年7月，中国证监会以证券公司风险管理能力为基础，结合公司市场影响力对证券公司进行了重新分类，支持优质证券公司做大做强。
2007年8月底，证券公司综合治理工作成功结束，实现了各项主要目标。
5.发行制度改革
发行审核制度透明化。证券发行的市场约束得到强化。发行定价机制市场化。
例题：单项选择题
中国证券市场逐步规范化，其中发行制度的发展( B )。
A 始终是审批制 B 由审批制到核准制 C 始终是核准制 D 由核准制到审批制
6.基金业市场化改革及机构投资者发展
2000年起，中国证监会提出"超常规发展机构投资者"，并将其作为改善资本市场投资者结构的重要举措。2002年以来，中国基金业推出了成熟市场绝大多数主流基金产品，丰富了投资者的选择。对外开放稳步推进，推动形成有效竞争格局。2002年7月，《外资参股基金管理公司设立规则》开始施行，截至2007年底，59家基金管理公司中有28家合资基金管理公司，内资公司、合资公司和QFII形成机构投资者间有效竞争的格局。此外，随着资本市场的发展，保险、社保基金以及企业年金等机构投资者逐步进入资本市场，初步改善了资本市场的投资者结构及各类机构投资者发展不平衡的局面。
7.资本市场法律体系逐步完善
2005年10月全国人大修订了《公司法》和《证券法》(简称"两法")，并于2006年1月1日开始实施。与"两法"的修订相适应，全国人大、国务院各部委对相关法律法规和部门规章进行了梳理和调整。出台《刑法修正案(六)》，修订了《企业破产法》。中国证监会陆续颁布了《冻结、查封实施办法》、《上市公司治理准则》、《上市公司股东大会规则》、《上市公司章程指引(2006年修订)》、《上市公司非公开发行股票实施细则》、《证券公司董事、监事和高级管理人员任职资格监管办法》、《证券结算风险基金管理办法》等一批规章和规范性文件，基本形成了与"两法"配套的规章体系。