自2009年1月12日起，深交所启用综合协议交易平台，取代原有大宗交易系统。
协议平台是指交易所为会员和合格投资者进行各类证券大宗交易或协议交易提供的交易系统。
(1)下列交易可以通过协议平台进行：
①权益类证券大宗交易，包括A股、B股、基金等。
②债券大宗交易，包括国债、企业债券、公司债券、分离交易的可转换公司债券、可转换公司债券和债券质押式回购等。
③专项资产管理计划收益权份额协议交易(“专项资产管理计划协议交易”)。
④交易所规定的其他交易。
(2)根据《深圳证券交易所交易规则》的规定，在深圳证券交易所进行的证券买卖符合以下条件的，可以采用大宗交易方式：
(1)A股单笔交易数量不低于50万股，或者交易金额不低于300万元人民币;
(2)B股单笔交易数量不低于5万股，或者交易金额不低于30万元港币;
(3)基金单笔交易数量不低于300万份，或者交易金额不低于300万元人民币;
(4)债券单笔交易数量不低于5000张(以人民币100元面额为1张)，或者交易金额不低于50万元人民币;
(5)债券质押式回购单笔交易数量不低于5000张(以人民币100元面额为1张)，或者交易金额不低于50万元人民币;
(6)多只A股合计单向买入或卖出的交易金额不低于500万元人民币，且其中单只A股的交易数量不低于20万股;
(7)多只基金合计单向买入或卖出的交易金额不低于500万元人民币，且其中单只基金的交易数量不低于100万份;
(8)多只债券合计单向买入或卖出的交易金额不低于500万元人民币，且其中单只债券的交易数量不低于1.5万张。
两交易所的归纳：
(1)A股和基金，沪深相同(A股单笔不低于50万股、300万元;基金300万份、300万元);
(2)B股单笔，沪市50万股，深市5万股;交易额均不低于30万(沪市是美元，深市是港币);
(3)沪市的国债及债券回购单笔不低于1000万元(1万手);
(4)其余债券(沪市其他债券1000手、100万元;深市债券及债券质押式回购5000张、50万元);
(5)深市多支合计的，交易额均不低于500万元。如是A股，单只不少于20万股;如是基金，单只不少于100万份;如是债券，单只不少于1.5万张。
协议平台接受用户申报的时间为每个交易日9：15-11：30、13：00-15：30.申报当日有效。当天全天停牌的证券，协议平台不接受其有关的申报。
协议平台接受交易用户申报的类型包括：意向申报、定价申报、双边报价、成交申报和其他申报。
(3)协议平台按不同业务类型分别确认成交，具体成交的时间规定为：
①权益类证券大宗交易、债券大宗交易(除公司债券外)，协议平台的成交确认时间为每个交易日15：00-15：30.
②公司债券的大宗交易、专项资产管理计划协议交易，协议平台的成交确认时间为每个交易日9：15-11：30、13：00-15：30.
(4)协议平台对申报价格和数量一致的成交申报和定价申报进行成交确认。用户对各交易品种申报的价格应当符合相关规定，交易方可成交。
①权益类证券大宗交易中，该证券有价格涨跌幅限制的，由买卖双方在其当日涨跌幅价格限制范围内确定;该证券无价格涨跌幅限制的，由买卖双方在前收盘价的上下30%或当日已成交的最高价、最低价之间自行协商确定。
②债券大宗交易价格，由买卖双方在前收盘价的上下30%或当日已成交的最高价、最低价之间自行协商确定。
③专项资产管理计划协议交易价格，由买卖双方自行协议确定。
符合《深圳证券交易所交易规则》并由协议平台确认的成交，买卖双方必须承认交易结果。协议平台用户应当保证其自身或投资者实际拥有与申报时相对应的足额资金或证券数量。因资金或证券数量不足造成交收失败的，协议平台用户应按照中国结算深圳分公司的规定承担由此引起的相关责任。
债券大宗交易以及专项资产管理计划协议交易实行当日回转交易。
(5)交易所每个交易日通过协议平台、交易所网站等方式对外发布协议平台交易信息。
(二)回转交易
证券的回转交易是指投资者买入的证券，经确认成交后，在交收前全部或部分卖出。
债券和权证实行当日回转交易，投资者可以在交易日的任何营业时间内反向卖出已买入但未交收的债券和权证。
B股实行次交易日起回转交易。
深交所对专项资产管理计划收益权份额协议交易也实行当日回转交易。