渗透结晶型防水涂料不是由材料自身的涂布层来达到防水性能，而是使混凝土的密致化，并与其成为一体来发挥防水效果。正因为如此，对混凝土基层的检视及处理是相当重要的工作，因此判断混凝土的基层面是否适当，并迅速地加以施工是其防水工法的重点。
基层的一般条件
① 混凝土拆除模板后，其结构强度属正常水平，且密度基本符合规范要求。
② 待涂刷的混凝土表面须平整、坚实，符合防水作业的常规技术规范要求。
③ 防水作业表面应干净、无油污、灰尘及其它杂物。
④ 无积水，即将涂刷的防水涂料完工后48小时内不得积水。
2、防水基面准备及其处理方法
① 水泥浮浆
常见于楼板面及大底板上面施工缝。以刮除、凿除、 磨光等方法彻底去除混凝土面的杂物和浮浆， 并清洗混凝土基面，使防水涂料能密切接合。
② 施工缝
施工缝包括楼板与墙壁之接缝、墙壁中间的施工缝（水平施工缝、冷缝、垂直施工缝）。施工缝处的蜂窝及水泥乳皮货杂物的沉积，容易形成漏水。沿着施工缝将新混凝土凿成 U 型槽，并使用渗透结晶型防水材料 基层处理剂进行修补、 抹平、 压实。
③ 蜂窝
多见于墙面， 有时亦可见于天花板面， 特别在墙面之施工缝附近容易产生。 在混凝土表面发现蜂窝时，将蜂窝及其四周围松脱物打除，并用基层处理剂填实、抹平。
④ 油污
灰尘、油脂类、污垢及铁锈会影响渗透结晶型防水涂料的接着性能，尤其是油脂类会形成隔膜而阻碍渗透结晶型防水涂料的渗透作用，因此必清除干净。
清水模板的脱膜剂，因具有高度的疏水性及泼水性，亦会阻碍渗透结晶型防水涂料的渗透作用，因此在脱模后需用水清洗混凝土表面，必要时可用铁丝刷清理这些表面区域。
⑤ 裂缝
超过0.4mm的裂缝，均须加以处理。
⑥ 模板固定器
若使用固定头之间隔器时， 须在间隔器之周围挖掘U型槽，并在U型槽之较深处切断钢筋，并用基层处理剂填实，压平。
⑦ 渗漏部位
防水施工前，一切渗漏部位均须进行修补和封堵，使得防水施工面不至积水或流水。
渗透结晶型防水涂料施工前对基层面检视及处理工作，是渗透结晶型防水材料本体防水机理得以发挥作用的重要环节，是必不可少的施工步骤。